PrimeMate: Générateur de primers rapide et simplifié pour Ensembl
PrimeMate est une extension Chrome développée par PrimeMate qui sert de générateur d'amorce pour Ensembl. Il permet aux utilisateurs de générer des centaines de paires d'amorces avec des paramètres personnalisables et de les trier selon leurs préférences.
Avec PrimeMate, les utilisateurs peuvent facilement travailler avec la base de données génomique Ensembl en naviguant simplement vers la séquence souhaitée et en cliquant sur "trouver des amorces". L'extension offre une gamme d'options personnalisables telles que la longueur optimale du produit, la température de fusion, le contenu en G/C et le seuil de dimérisation/épingle à cheveux.
Une des fonctionnalités phares de PrimeMate est sa capacité à afficher des informations détaillées pour chaque produit, notamment la longueur, la température de fusion et l'emplacement de l'exon. Les utilisateurs peuvent également trier les résultats générés en fonction de leurs critères préférés en ajustant le poids de tri pour chaque variable.
PrimeMate va encore plus loin en filtrant automatiquement les produits indésirables, tels que les amorces à auto-dimérisation ou celles avec des emplacements sous-optimaux sur la séquence. Il offre également la possibilité de sauvegarder les séquences sélectionnées par l'utilisateur dans une ligne "Favoris" pour un accès facile et permet un partage facile en copiant les séquences dans le presse-papiers.
En résumé, PrimeMate est un outil puissant et efficace pour la génération d'amorces dans Ensembl, offrant une interface conviviale et une large gamme d'options personnalisables.
